Projet 4D-OMICs
Le projet 4D-OMICs construit un instrument numérique pour la biologie quantitative multi-échelle en Région Sud. Il regroupe Aix-Marseille Université (AMU), Université Côte d’Azur (UCA), l’Assistance Public des Hôpitaux de Marseille (AP-HM), l’Institut Paoli Calmette (IPC), le CNRS, EURCOM, l’INRAE et l’INSERM.
Ce projet rassemble les équipements et les ressources nécessaires pour réaliser des programmes à fort impact qui nécessitent un stockage massif de données et un calcul performant. 4D-omics met en place une plateforme de données très visible en biologie, bien articulée avec l’ensemble des infrastructures nationales en biologie et en santé.
Le CEDRE au travers de son pôle INFRA a été chargé de conception et de la mise en œuvre des moyens de stockage et le calcul dans de ce projet dans le DataCenter Sud.
Après avoir réalisé la collecte des besoins auprès des partenaires sous la responsabilité d’Aix-Marseille Université, CEDRE a réalisé une étude pour optimiser l’achat des matériels de stockage et de calcul. Il a déployé et mis en œuvre ses moyens pour la communauté de Recherche et participe activement a son maintien en condition opérationnel.
Le projet 4D-OMICs au sein d’Aix-M
...Le projet 4D-OMICs construit un instrument numérique pour la biologie quantitative multi-échelle en Région Sud. Il regroupe Aix-Marseille Université (AMU), Université Côte d’Azur (UCA), l’Assistance Public des Hôpitaux de Marseille (AP-HM), l’Institut Paoli Calmette (IPC), le CNRS, EURCOM, l’INRAE et l’INSERM.
Ce projet rassemble les équipements et les ressources nécessaires pour réaliser des programmes à fort impact qui nécessitent un stockage massif de données et un calcul performant. 4D-omics met en place une plateforme de données très visible en biologie, bien articulée avec l’ensemble des infrastructures nationales en biologie et en santé.
Le CEDRE au travers de son pôle INFRA a été chargé de conception et de la mise en œuvre des moyens de stockage et le calcul dans de ce projet dans le DataCenter Sud.
Après avoir réalisé la collecte des besoins auprès des partenaires sous la responsabilité d’Aix-Marseille Université, CEDRE a réalisé une étude pour optimiser l’achat des matériels de stockage et de calcul. Il a déployé et mis en œuvre ses moyens pour la communauté de Recherche et participe activement a son maintien en condition opérationnel.
Le projet 4D-OMICs au sein d’Aix-Marseille Université c’est :
- Un ingénieur à temps plein piloté par CEDRE
- 3,2 M d’euros de matériels
- +10 laboratoires de recherche sous tutelle d’AMU impactés
URL du projet : https://4d-omics.univ-cotedazur.fr/
Projet COMP RI
COMP RI désigne le Contrat Objectif, de Moyen et de Performance en Recherche et Innovation.
C'est une politique de site très active est menée avec et par l’ensemble des partenaires du site d’Aix-Marseille, avec qui elle a co-construit toutes les réponses aux appels à projets France 2030 (EQUIPEX+, CISAM+, SFRI, ASDESR, PUI …). Cette dynamique se traduit par la multiplication d’actions communes (réseau des référents Développement Durable et innovation, Science ouverte, science et société, plateformes technologiques, données de la recherche, …) et une volonté de partage de l’ensemble des données liées à la gestion des unités. La principale difficulté est le manque d’outils de gestion et de pilotage commun à l’ensemble des partenaires, et il est très peu probable que ces outils soient opérationnels au niveau national dans un délai compatible avec les ambitions de l’établissement.
L’objectif de ce projet est donc de développer un outil permettant d’avoir un suivi dynamique des compétences et des projets des unités du site. Il se déroulera en deux phases :
- Réalisation d’une base de données de l’ensemble des projets déposés par les chercheurs et enseignants-chercheurs des unités
COMP RI désigne le Contrat Objectif, de Moyen et de Performance en Recherche et Innovation.
C'est une politique de site très active est menée avec et par l’ensemble des partenaires du site d’Aix-Marseille, avec qui elle a co-construit toutes les réponses aux appels à projets France 2030 (EQUIPEX+, CISAM+, SFRI, ASDESR, PUI …). Cette dynamique se traduit par la multiplication d’actions communes (réseau des référents Développement Durable et innovation, Science ouverte, science et société, plateformes technologiques, données de la recherche, …) et une volonté de partage de l’ensemble des données liées à la gestion des unités. La principale difficulté est le manque d’outils de gestion et de pilotage commun à l’ensemble des partenaires, et il est très peu probable que ces outils soient opérationnels au niveau national dans un délai compatible avec les ambitions de l’établissement.
L’objectif de ce projet est donc de développer un outil permettant d’avoir un suivi dynamique des compétences et des projets des unités du site. Il se déroulera en deux phases :
- Réalisation d’une base de données de l’ensemble des projets déposés par les chercheurs et enseignants-chercheurs des unités de l’AMU
- Développement d’un logiciel de fouille de texte permettant de faire ressortir les expertises et les compétences des équipes
Cette approche est particulièrement pertinente pour l’université d’Aix-Marseille qui mène depuis plusieurs années une politique volontariste et incitative de dépôts des textes entiers dans HAL, et se rapproche de l’UP1 pour adapter ce qu’ils ont déjà développé. L’analyse des données descriptives des projets permettra de cartographier des partenaires académiques et socio-économiques de l’AMU en lien avec des domaines scientifiques, et de connaitre les chercheurs ou équipes particulièrement actifs dans la recherche partenariale et identifiés comme des experts de leur domaine. L’analyse des textes des projets nécessitera un développement plus conséquent, mais il existe déjà des compétences en interne dans ce domaine (laboratoire LIS UMR 7020, Open Edition, …)